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IBM超级计算集群助力美国乔治亚理工学院加快药物研发

  2006年03月16日  

IBM和乔治亚理工学院日前宣布,世界上最强大的超级计算集群之一将落户乔治亚理工学院新建成的系统生物学研究中心。

该中心将使用IBM技术来推动新药物的研究,治疗当今一些对人类生命威胁最大的疾病,包括癌症。中心的研究工作将由世界领先的系统生物学家之一Jeffrey Skolnick博士领导,他曾在计算系统生物学领域获得乔治亚研究联盟杰出学者奖。

由美国乔治亚州、乔治亚研究联盟和美国国家健康协会出资850万美元成立的这一新系统生物学研究中心,将Skolnick博士的生物医学研究的专业知识与IBM的高性能计算功能融合在一起,开发出一台全新的超级计算机。这个运行Linux的全新超级计算集群将是全球运行速度最快的超级计算集群之一,也是美国东南部研究型大学最强大的计算集群之一。该集群将由BellSouth公司设在亚特兰大市中心的世界级设施来托管运行。

由1000个节点组成的Cluster 1350系统基于IBM BladeCenter刀片系统,采用双内核AMD Opteron处理器,每秒钟可完成超过8.5万亿次计算。系统性能和可扩展性将使学校的学生和教员能够快速准确的分析复杂的DNA和蛋白质,以确定有关人体癌症基因和蛋白质的生物学和化学过程,从而为治疗这类疾病研发出更具针对性的药物。

通过与乔治亚理工学院和IBM的紧密合作,BellSouth为支持这一高能耗密度的超级计算集群设计了可靠的主机托管环境。

另外,IBM提供的技术还包括28TB的IBM DS4800存储系统和20TB的IBM DS4100存储系统,以便存储大量的研究数据并提供灾难恢复备份能力。除此之外,IBM BladeCenter中还集成了Force10 TeraScale E-系列交换机/路由器,这些交换机和路由器可以提供弹性互连,能够支持可预测的集群性能和可扩展性,这样,乔治亚理工学院将可以对集群进行无缝扩展。

这一解决方案还包括了产品代码为“酷蓝[Cool Blue]”的IBM散热系统(IBM Rear Door Heat eXchanger),这一技术组件可以使用现有的冷却水源来支持大部分客户数据中心内部已经安装的空调系统,最多可将服务器排放到室内的热量减少55%。乔治亚理工学院已经在12个机架上安装了“酷蓝”,它不仅降低了噪音,而且减少了现有空调系统的负荷。这种散热系统最多可将首次安装成本降低40%,同时降低近15%的能源成本。

新的集群解决方案帮助提高该研究中心的数据中心的总体性能,同时降低了总拥有成本。另外,系统的速度和灵活性也缩短了研究项目完成时间,研究中心因此而能够有更多的时间拓展药物科学和医疗领域的更多商业机会。

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