生物医疗研究人员翘首盼望着“生物硅”实验方法新时代的出现,以计算机为基础的数据挖掘及仿真将取代缓慢而辛苦的生物实验。
破解DNA及百般折磨人类的疾病如癌症和心脏病之间的联系推动着一个新兴产业的发展,即片上实验室(lab-on-a-chip)硬件及生物信息软件产业。作为主题演讲人出席近期在斯坦福大学召开的Biosilico 2003会议的Systems Biology西雅图学院院长Leroy Hood表示,信息挖掘及计算机仿真将无法破解生物系统的复杂性。相反,生物研究会必须在系统分析基础上构建模型,然后设计实验。在重复过程中,实验结果与模型预测相比较,计算机模型也相应地得到修改。
DNA实验分析缩减到芯片级使生物医疗研究人员对信息引发了爆炸性的需求。主要焦点载誉使生物信息标准化,建立数据挖掘“生物信息”系统,允许研究团体真正从新信息中获益。
分子生物学、破解基因组及蛋白质研究在过去数十年里取得了根本性的突破,但它们仅代表对生物有机体整个系统有了一个初始的认识。该学院与MIT的Whitehead Institute合作开发了一个开放源软件包Cytoscape,包含了蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA及基因作用,并把他们映射到互相连接的图形表述中。
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